З 29 березня 2009 року новий прикордонний режим запроваджено в усіх аеропортах конфедерації. Паспортний контроль скасовано для пасажирів внутрішніх європейських рейсів, що здійснюються між 25 державами, які підписали Шенгенську угоду (всі країни Євросоюзу за винятком Великої Британії та Ірландії).
В аеропортах Швейцарії з'являться окремі авіатермінали для рейсів із Шенгенської зони та інших країн, а також збережуться митні пункти, на яких здійснюватимуться вибіркові перевірки. Як повідомляє Deutsche Welle, поки митні перевірки будуть збережені, а у випадках, якщо у прикордонників виникнуть якісь підозри, можлива і перевірка документів.